Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA4P43681 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA4P43681 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA4P43681 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA4P43681 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA4P43681 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA4P43681 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms