Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKAP35790 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKAP35790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHKAP35790 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHKAP35790 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHKAP35790 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHKAP35790 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHKAP35790 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHKAP35790 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKAP35790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKAP35790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHKAP35790 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHKAP35790 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHKAP35790 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHKAP35790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHKAP35790 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHKAP35790 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKAP35790 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKAP35790 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKAP35790 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHKAP35790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHKAP35790 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHKAP35790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHKAP35790 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHKAP35790 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKAP35790 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKAP35790 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKAP35790 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHKAP35790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHKAP35790 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHKAP35790 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHKAP35790 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHKAP35790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKAP35790 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKAP35790 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKAP35790 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKAP35790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKAP35790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHKAP35790 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHKAP35790 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHKAP35790 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHKAP35790 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHKAP35790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHKAP35790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHKAP35790 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHKAP35790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKAP35790 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHKAP35790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHKAP35790 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHKAP35790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHKAP35790 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHKAP35790 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHKAP35790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHKAP35790 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHKAP35790 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHKAP35790 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHKAP35790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKAP35790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKAP35790 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKAP35790 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKAP35790 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKAP35790 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHKAP35790 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKAP35790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKAP35790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKAP35790 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKAP35790 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKAP35790 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHKAP35790 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKAP35790 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKAP35790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHKAP35790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHKAP35790 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHKAP35790 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHKAP35790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHKAP35790 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHKAP35790 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHKAP35790 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHKAP35790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKAP35790 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKAP35790 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKAP35790 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKAP35790 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKAP35790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKAP35790 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHKAP35790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHKAP35790 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHKAP35790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHKAP35790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHKAP35790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHKAP35790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHKAP35790 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHKAP35790 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHKAP35790 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHKAP35790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHKAP35790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHKAP35790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHKAP35790 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHKAP35790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHKAP35790 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms