Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC1P35251 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC1P35251 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC1P35251 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFC1P35251 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFC1P35251 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC1P35251 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC1P35251 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC1P35251 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFC1P35251 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC1P35251 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC1P35251 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC1P35251 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC1P35251 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC1P35251 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFC1P35251 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC1P35251 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC1P35251 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC1P35251 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC1P35251 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFC1P35251 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFC1P35251 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFC1P35251 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RFC1P35251 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFC1P35251 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFC1P35251 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFC1P35251 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFC1P35251 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFC1P35251 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFC1P35251 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFC1P35251 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFC1P35251 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC1P35251 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC1P35251 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC1P35251 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC1P35251 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC1P35251 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFC1P35251 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFC1P35251 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFC1P35251 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFC1P35251 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFC1P35251 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFC1P35251 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFC1P35251 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFC1P35251 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFC1P35251 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFC1P35251 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFC1P35251 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFC1P35251 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RFC1P35251 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFC1P35251 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFC1P35251 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFC1P35251 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFC1P35251 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFC1P35251 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFC1P35251 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFC1P35251 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFC1P35251 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFC1P35251 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFC1P35251 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFC1P35251 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFC1P35251 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFC1P35251 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RFC1P35251 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFC1P35251 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFC1P35251 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFC1P35251 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFC1P35251 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RFC1P35251 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFC1P35251 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RFC1P35251 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFC1P35251 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFC1P35251 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFC1P35251 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC1P35251 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC1P35251 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC1P35251 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC1P35251 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC1P35251 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC1P35251 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC1P35251 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC1P35251 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC1P35251 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC1P35251 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC1P35251 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC1P35251 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC1P35251 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC1P35251 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms