Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRA3P34903 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRA3P34903 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRA3P34903 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRA3P34903 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms