Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP1P28562 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP1P28562 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP1P28562 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms