Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IL3RAP26951 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IL3RAP26951 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL3RAP26951 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL3RAP26951 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms