Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACO1P21399 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACO1P21399 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACO1P21399 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ACO1P21399 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACO1P21399 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACO1P21399 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACO1P21399 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ACO1P21399 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACO1P21399 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACO1P21399 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACO1P21399 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACO1P21399 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACO1P21399 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACO1P21399 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACO1P21399 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACO1P21399 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACO1P21399 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACO1P21399 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACO1P21399 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACO1P21399 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACO1P21399 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACO1P21399 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACO1P21399 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACO1P21399 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACO1P21399 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACO1P21399 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACO1P21399 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACO1P21399 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACO1P21399 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACO1P21399 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACO1P21399 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACO1P21399 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACO1P21399 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACO1P21399 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACO1P21399 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACO1P21399 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACO1P21399 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACO1P21399 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACO1P21399 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACO1P21399 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACO1P21399 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACO1P21399 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ACO1P21399 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACO1P21399 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACO1P21399 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACO1P21399 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACO1P21399 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACO1P21399 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACO1P21399 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACO1P21399 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACO1P21399 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACO1P21399 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACO1P21399 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACO1P21399 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACO1P21399 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACO1P21399 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ACO1P21399 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ACO1P21399 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACO1P21399 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACO1P21399 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACO1P21399 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ACO1P21399 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACO1P21399 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACO1P21399 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ACO1P21399 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACO1P21399 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACO1P21399 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACO1P21399 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms