Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRM3P20309 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRM3P20309 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRM3P20309 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRM3P20309 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRM3P20309 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRM3P20309 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms