Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RXRAP19793 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RXRAP19793 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RXRAP19793 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RXRAP19793 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RXRAP19793 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RXRAP19793 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RXRAP19793 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RXRAP19793 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RXRAP19793 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RXRAP19793 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RXRAP19793 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RXRAP19793 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RXRAP19793 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RXRAP19793 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RXRAP19793 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RXRAP19793 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RXRAP19793 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RXRAP19793 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RXRAP19793 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RXRAP19793 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RXRAP19793 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RXRAP19793 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RXRAP19793 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RXRAP19793 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RXRAP19793 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RXRAP19793 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RXRAP19793 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RXRAP19793 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RXRAP19793 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RXRAP19793 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RXRAP19793 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RXRAP19793 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RXRAP19793 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RXRAP19793 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RXRAP19793 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RXRAP19793 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RXRAP19793 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RXRAP19793 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RXRAP19793 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RXRAP19793 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RXRAP19793 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RXRAP19793 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RXRAP19793 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RXRAP19793 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RXRAP19793 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RXRAP19793 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RXRAP19793 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RXRAP19793 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RXRAP19793 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RXRAP19793 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RXRAP19793 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RXRAP19793 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RXRAP19793 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RXRAP19793 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RXRAP19793 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RXRAP19793 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RXRAP19793 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RXRAP19793 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RXRAP19793 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RXRAP19793 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RXRAP19793 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RXRAP19793 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RXRAP19793 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RXRAP19793 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RXRAP19793 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RXRAP19793 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RXRAP19793 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RXRAP19793 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms