Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXB9P17482 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB9P17482 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB9P17482 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB9P17482 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB9P17482 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms