Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTLA4P16410 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTLA4P16410 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTLA4P16410 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms