Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARGP13631 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARGP13631 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARGP13631 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARGP13631 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RARGP13631 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARGP13631 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RARGP13631 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RARGP13631 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RARGP13631 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARGP13631 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARGP13631 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARGP13631 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RARGP13631 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RARGP13631 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARGP13631 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARGP13631 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARGP13631 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARGP13631 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARGP13631 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RARGP13631 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARGP13631 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RARGP13631 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARGP13631 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RARGP13631 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RARGP13631 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RARGP13631 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RARGP13631 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARGP13631 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARGP13631 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARGP13631 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARGP13631 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARGP13631 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARGP13631 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RARGP13631 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RARGP13631 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARGP13631 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARGP13631 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARGP13631 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARGP13631 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARGP13631 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARGP13631 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARGP13631 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARGP13631 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARGP13631 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RARGP13631 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARGP13631 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARGP13631 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARGP13631 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARGP13631 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARGP13631 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARGP13631 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARGP13631 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARGP13631 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARGP13631 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARGP13631 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARGP13631 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARGP13631 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RARGP13631 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARGP13631 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARGP13631 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARGP13631 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARGP13631 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RARGP13631 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARGP13631 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARGP13631 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARGP13631 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARGP13631 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARGP13631 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RARGP13631 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARGP13631 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARGP13631 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARGP13631 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARGP13631 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARGP13631 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARGP13631 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARGP13631 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARGP13631 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RARGP13631 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARGP13631 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARGP13631 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARGP13631 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARGP13631 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RARGP13631 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARGP13631 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARGP13631 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARGP13631 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARGP13631 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARGP13631 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARGP13631 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARGP13631 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RARGP13631 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARGP13631 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARGP13631 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARGP13631 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARGP13631 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RARGP13631 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARGP13631 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARGP13631 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARGP13631 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms