Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRM1P11229 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRM1P11229 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRM1P11229 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRM1P11229 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms