Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ90

DUX4L7, Double homeobox protein 4-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L7P0CJ90 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUX4L7P0CJ90 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUX4L7P0CJ90 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUX4L7P0CJ90 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUX4L7P0CJ90 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms