Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC159P0C7I6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC159P0C7I6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC159P0C7I6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms