Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYNP07948 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYNP07948 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYNP07948 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYNP07948 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYNP07948 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYNP07948 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYNP07948 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYNP07948 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYNP07948 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYNP07948 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYNP07948 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYNP07948 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYNP07948 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYNP07948 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYNP07948 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYNP07948 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LYNP07948 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYNP07948 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYNP07948 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LYNP07948 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYNP07948 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYNP07948 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYNP07948 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYNP07948 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYNP07948 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYNP07948 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LYNP07948 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYNP07948 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYNP07948 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYNP07948 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYNP07948 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYNP07948 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYNP07948 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYNP07948 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYNP07948 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYNP07948 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYNP07948 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYNP07948 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYNP07948 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYNP07948 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYNP07948 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYNP07948 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYNP07948 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYNP07948 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYNP07948 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYNP07948 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYNP07948 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYNP07948 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYNP07948 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYNP07948 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYNP07948 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYNP07948 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYNP07948 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYNP07948 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYNP07948 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYNP07948 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYNP07948 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYNP07948 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYNP07948 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYNP07948 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYNP07948 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYNP07948 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYNP07948 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYNP07948 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYNP07948 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYNP07948 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYNP07948 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LYNP07948 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYNP07948 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYNP07948 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYNP07948 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYNP07948 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYNP07948 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYNP07948 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYNP07948 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYNP07948 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYNP07948 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYNP07948 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYNP07948 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYNP07948 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYNP07948 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms