Protein–RNA interactions for Protein: P04798

CYP1A1, Cytochrome P450 1A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1A1P04798 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP1A1P04798 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP1A1P04798 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP1A1P04798 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP1A1P04798 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP1A1P04798 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms