Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP1P03956 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MMP1P03956 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MMP1P03956 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP1P03956 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP1P03956 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP1P03956 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP1P03956 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MMP1P03956 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP1P03956 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP1P03956 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP1P03956 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP1P03956 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP1P03956 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MMP1P03956 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MMP1P03956 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP1P03956 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP1P03956 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP1P03956 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP1P03956 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP1P03956 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP1P03956 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP1P03956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP1P03956 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP1P03956 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP1P03956 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MMP1P03956 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP1P03956 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MMP1P03956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MMP1P03956 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MMP1P03956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMP1P03956 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMP1P03956 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMP1P03956 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MMP1P03956 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MMP1P03956 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MMP1P03956 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMP1P03956 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMP1P03956 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMP1P03956 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMP1P03956 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MMP1P03956 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MMP1P03956 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MMP1P03956 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MMP1P03956 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MMP1P03956 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MMP1P03956 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MMP1P03956 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MMP1P03956 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MMP1P03956 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MMP1P03956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MMP1P03956 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MMP1P03956 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MMP1P03956 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMP1P03956 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMP1P03956 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MMP1P03956 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MMP1P03956 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MMP1P03956 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MMP1P03956 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP1P03956 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP1P03956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP1P03956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP1P03956 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP1P03956 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MMP1P03956 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MMP1P03956 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MMP1P03956 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MMP1P03956 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MMP1P03956 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MMP1P03956 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MMP1P03956 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MMP1P03956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MMP1P03956 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MMP1P03956 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP1P03956 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP1P03956 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP1P03956 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP1P03956 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP1P03956 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMP1P03956 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMP1P03956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMP1P03956 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MMP1P03956 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MMP1P03956 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MMP1P03956 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP1P03956 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP1P03956 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP1P03956 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP1P03956 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP1P03956 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP1P03956 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP1P03956 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms