Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOA2P02652 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOA2P02652 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA2P02652 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA2P02652 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA2P02652 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA2P02652 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOA2P02652 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA2P02652 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA2P02652 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA2P02652 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOA2P02652 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA2P02652 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA2P02652 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA2P02652 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA2P02652 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOA2P02652 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA2P02652 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA2P02652 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA2P02652 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOA2P02652 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA2P02652 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA2P02652 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA2P02652 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA2P02652 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA2P02652 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOA2P02652 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA2P02652 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA2P02652 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOA2P02652 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA2P02652 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA2P02652 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOA2P02652 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA2P02652 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA2P02652 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA2P02652 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA2P02652 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA2P02652 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOA2P02652 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOA2P02652 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA2P02652 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOA2P02652 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOA2P02652 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA2P02652 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA2P02652 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA2P02652 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA2P02652 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOA2P02652 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA2P02652 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA2P02652 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOA2P02652 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA2P02652 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA2P02652 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA2P02652 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA2P02652 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA2P02652 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA2P02652 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA2P02652 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA2P02652 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA2P02652 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA2P02652 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA2P02652 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA2P02652 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA2P02652 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA2P02652 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA2P02652 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA2P02652 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA2P02652 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA2P02652 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA2P02652 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA2P02652 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA2P02652 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms