Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOP3BO95985 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOP3BO95985 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TOP3BO95985 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP3BO95985 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP3BO95985 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms