Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN12O95859 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN12O95859 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN12O95859 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSPAN12O95859 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN12O95859 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms