Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPO95630 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAMBPO95630 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STAMBPO95630 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPO95630 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPO95630 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms