Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDNEP1O95476 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1O95476 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1O95476 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1O95476 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms