Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAF4O95104 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCAF4O95104 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAF4O95104 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCAF4O95104 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms