Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX2-2O95096 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-2O95096 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-2O95096 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms