Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEBLO76041 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEBLO76041 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEBLO76041 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEBLO76041 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEBLO76041 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEBLO76041 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEBLO76041 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEBLO76041 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEBLO76041 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEBLO76041 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEBLO76041 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEBLO76041 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEBLO76041 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEBLO76041 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEBLO76041 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEBLO76041 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEBLO76041 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEBLO76041 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEBLO76041 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEBLO76041 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEBLO76041 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEBLO76041 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEBLO76041 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEBLO76041 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEBLO76041 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEBLO76041 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEBLO76041 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEBLO76041 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEBLO76041 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEBLO76041 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEBLO76041 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEBLO76041 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEBLO76041 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEBLO76041 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEBLO76041 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEBLO76041 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEBLO76041 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEBLO76041 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEBLO76041 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEBLO76041 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEBLO76041 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEBLO76041 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEBLO76041 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEBLO76041 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEBLO76041 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEBLO76041 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEBLO76041 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEBLO76041 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms