Protein–RNA interactions for Protein: O60739

EIF1B, Eukaryotic translation initiation factor 1b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF1BO60739 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF1BO60739 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF1BO60739 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF1BO60739 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms