Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL41O60662 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL41O60662 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL41O60662 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms