Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCM3APO60318 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCM3APO60318 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM3APO60318 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM3APO60318 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms