Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRS3O43559 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRS3O43559 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRS3O43559 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRS3O43559 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRS3O43559 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRS3O43559 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRS3O43559 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRS3O43559 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRS3O43559 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRS3O43559 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRS3O43559 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRS3O43559 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRS3O43559 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FRS3O43559 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRS3O43559 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRS3O43559 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FRS3O43559 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRS3O43559 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRS3O43559 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRS3O43559 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRS3O43559 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRS3O43559 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRS3O43559 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FRS3O43559 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRS3O43559 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRS3O43559 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRS3O43559 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRS3O43559 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRS3O43559 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRS3O43559 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRS3O43559 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRS3O43559 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRS3O43559 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRS3O43559 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRS3O43559 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRS3O43559 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRS3O43559 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRS3O43559 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRS3O43559 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRS3O43559 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRS3O43559 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRS3O43559 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRS3O43559 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRS3O43559 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRS3O43559 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRS3O43559 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRS3O43559 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRS3O43559 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRS3O43559 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRS3O43559 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRS3O43559 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRS3O43559 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRS3O43559 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRS3O43559 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRS3O43559 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRS3O43559 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRS3O43559 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRS3O43559 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRS3O43559 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRS3O43559 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRS3O43559 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRS3O43559 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRS3O43559 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRS3O43559 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRS3O43559 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRS3O43559 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRS3O43559 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRS3O43559 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRS3O43559 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRS3O43559 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRS3O43559 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRS3O43559 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRS3O43559 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRS3O43559 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRS3O43559 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1230.2 ms