Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNAB3O43448 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNAB3O43448 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNAB3O43448 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNAB3O43448 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms