Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI3O43414 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERI3O43414 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERI3O43414 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI3O43414 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERI3O43414 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERI3O43414 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI3O43414 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI3O43414 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERI3O43414 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERI3O43414 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERI3O43414 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERI3O43414 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERI3O43414 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI3O43414 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI3O43414 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI3O43414 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI3O43414 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI3O43414 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI3O43414 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERI3O43414 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERI3O43414 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERI3O43414 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERI3O43414 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERI3O43414 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERI3O43414 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERI3O43414 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERI3O43414 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERI3O43414 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERI3O43414 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERI3O43414 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERI3O43414 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERI3O43414 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERI3O43414 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI3O43414 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI3O43414 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI3O43414 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI3O43414 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI3O43414 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI3O43414 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI3O43414 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI3O43414 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI3O43414 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI3O43414 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI3O43414 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI3O43414 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI3O43414 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERI3O43414 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERI3O43414 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERI3O43414 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERI3O43414 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERI3O43414 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERI3O43414 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI3O43414 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI3O43414 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI3O43414 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI3O43414 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI3O43414 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI3O43414 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI3O43414 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms