Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCP110O43303 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCP110O43303 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCP110O43303 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCP110O43303 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCP110O43303 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCP110O43303 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCP110O43303 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCP110O43303 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCP110O43303 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCP110O43303 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCP110O43303 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCP110O43303 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCP110O43303 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCP110O43303 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCP110O43303 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCP110O43303 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCP110O43303 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCP110O43303 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCP110O43303 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCP110O43303 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCP110O43303 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCP110O43303 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCP110O43303 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCP110O43303 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCP110O43303 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCP110O43303 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCP110O43303 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCP110O43303 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCP110O43303 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCP110O43303 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCP110O43303 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCP110O43303 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCP110O43303 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCP110O43303 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCP110O43303 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCP110O43303 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCP110O43303 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCP110O43303 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCP110O43303 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCP110O43303 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCP110O43303 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCP110O43303 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCP110O43303 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCP110O43303 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCP110O43303 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCP110O43303 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCP110O43303 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCP110O43303 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCP110O43303 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCP110O43303 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCP110O43303 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCP110O43303 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCP110O43303 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CCP110O43303 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCP110O43303 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCP110O43303 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCP110O43303 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCP110O43303 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCP110O43303 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCP110O43303 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCP110O43303 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCP110O43303 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCP110O43303 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCP110O43303 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCP110O43303 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCP110O43303 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCP110O43303 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCP110O43303 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCP110O43303 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCP110O43303 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCP110O43303 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CCP110O43303 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCP110O43303 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCP110O43303 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCP110O43303 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCP110O43303 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCP110O43303 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCP110O43303 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCP110O43303 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCP110O43303 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCP110O43303 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCP110O43303 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCP110O43303 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCP110O43303 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCP110O43303 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCP110O43303 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCP110O43303 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms