Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP8O43159 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP8O43159 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP8O43159 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRP8O43159 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RRP8O43159 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP8O43159 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP8O43159 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP8O43159 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP8O43159 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RRP8O43159 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP8O43159 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP8O43159 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP8O43159 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RRP8O43159 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP8O43159 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP8O43159 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RRP8O43159 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP8O43159 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP8O43159 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP8O43159 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP8O43159 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP8O43159 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RRP8O43159 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP8O43159 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP8O43159 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP8O43159 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP8O43159 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP8O43159 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP8O43159 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP8O43159 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP8O43159 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP8O43159 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP8O43159 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP8O43159 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP8O43159 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP8O43159 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP8O43159 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP8O43159 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP8O43159 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP8O43159 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP8O43159 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP8O43159 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP8O43159 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP8O43159 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP8O43159 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRP8O43159 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRP8O43159 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP8O43159 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP8O43159 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP8O43159 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRP8O43159 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP8O43159 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP8O43159 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP8O43159 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRP8O43159 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP8O43159 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP8O43159 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP8O43159 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP8O43159 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP8O43159 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRP8O43159 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms