Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LINC01565O15544 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC01565O15544 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC01565O15544 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC01565O15544 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC01565O15544 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms