Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAPBPO15533 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAPBPO15533 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAPBPO15533 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAPBPO15533 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAPBPO15533 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms