Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMAD9O15198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAD9O15198 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAD9O15198 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAD9O15198 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms