Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCRL2O00421 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCRL2O00421 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCRL2O00421 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCRL2O00421 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCRL2O00421 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms