Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLRMTO00411 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLRMTO00411 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLRMTO00411 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
POLRMTO00411 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLRMTO00411 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLRMTO00411 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms