Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QRK9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QRK9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3QRK9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3QRK9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QRK9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QRK9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QRK9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QRK9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3QRK9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QRK9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QRK9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QRK9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3QRK9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QRK9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QRK9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QRK9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QRK9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QRK9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3QRK9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QRK9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QRK9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QRK9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QRK9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QRK9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QRK9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QRK9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QRK9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QRK9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QRK9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QRK9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QRK9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QRK9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QRK9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QRK9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QRK9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QRK9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QRK9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QRK9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QRK9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QRK9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QRK9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QRK9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QRK9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QRK9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QRK9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QRK9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QRK9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QRK9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QRK9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QRK9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QRK9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QRK9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QRK9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QRK9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QRK9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QRK9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QRK9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QRK9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QRK9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QRK9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QRK9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QRK9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QRK9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QRK9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
J3QRK9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QRK9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QRK9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QRK9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QRK9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QRK9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QRK9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms