Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C0S8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0S8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0S8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0S8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C0S8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H7C0S8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C0S8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C0S8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C0S8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0S8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0S8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C0S8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0S8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C0S8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C0S8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C0S8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C0S8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C0S8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C0S8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0S8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0S8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0S8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C0S8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0S8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0S8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C0S8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H7C0S8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H7C0S8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0S8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0S8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H7C0S8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H7C0S8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H7C0S8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0S8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0S8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0S8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H7C0S8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0S8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0S8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0S8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0S8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C0S8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C0S8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0S8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0S8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0S8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0S8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0S8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C0S8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C0S8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C0S8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C0S8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C0S8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C0S8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0S8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0S8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C0S8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0S8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0S8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H7C0S8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0S8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0S8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0S8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0S8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0S8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H7C0S8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H7C0S8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms