Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms