Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2CD4DB7Z1M9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2CD4DB7Z1M9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C2CD4DB7Z1M9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
C2CD4DB7Z1M9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2CD4DB7Z1M9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms