Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ELOA3DA6NLF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELOA3DA6NLF2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ELOA3DA6NLF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms