Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC01553A4QN01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LINC01553A4QN01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LINC01553A4QN01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LINC01553A4QN01 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms