Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM30A4D0T7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM30A4D0T7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM30A4D0T7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM30A4D0T7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms