Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMCO3A2RU48 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMCO3A2RU48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMCO3A2RU48 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms