Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GTL3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GTL3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GTL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1B0GTL3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A1B0GTL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A1B0GTL3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1B0GTL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1B0GTL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1B0GTL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms