Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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