Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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